A legfontosabb különbség a kalcium-hipoklorit és a nátrium-hipoklorit között az, hogy a kalcium-hipoklorit két hipoklorit-aniont tartalmaz, amelyek egy kalcium-kationhoz kapcsolódnak, míg a nátrium-hipoklorit egy hipoklorit-aniont tartalmaz, amely egy nátrium-kationhoz kapcsolódik. Megjelenésében a kalcium-hipoklorit fehér vagy szürke por, míg a nátrium-hipoklorit zöldes-sárga, édes illatú szilárd anyag.
A kalcium és a nátrium-hipoklorit olyan ionos vegyületek, amelyek fémkationt és klór eredetű aniont tartalmaznak. Ezeknek a vegyületeknek az anionjainak száma kationonként eltér a fémkation vegyértékétől függően.