A motívum és a tartomány közötti legfontosabb különbség az, hogy a motívum nem függetlenül stabil, míg a tartomány függetlenül stabil.
A fehérjék fontos biológiai makromolekulák, amelyek jelen vannak a testünkben. Másrészt egy gén genetikai kódja dönti el a fehérje aminosav-szekvenciáját. Sőt, a fehérjék primer, szekunder és tercier struktúrával rendelkeznek. Az elsődleges szerkezet a polipeptidlánc aminosavszekvenciája. Amikor a polipeptidláncok egymásra hajlanak, ez képezi a fehérje másodlagos szerkezetét. Az alfa hélixek, a béta lapok és a szuperszekunder struktúrák a másodlagos struktúrákhoz tartoznak. A szuperszekunder elemek bizonyos csoportosulása fehérje motívumként ismert. A fehérje harmadlagos szerkezete háromdimenziós szerkezetére utal, amely eldönti a fehérje működését. A domén egy fehérje molekula hajtogatott szakasza, amely gömb alakú és diszkrét funkcióval rendelkezik. Ez a fehérje alapvető funkcionális és háromdimenziós szerkezete.
