A legfontosabb különbség a Paget-kór és az ekcéma között az, hogy a Paget-kór a csontok átalakulásának gócos rendellenessége, az ekcéma pedig a bőr gyulladásos állapota, amelyet hólyagos elváltozások csoportjai jellemeznek, változó mértékű váladék és hámlás jellemzi.
A Paget-kór bizonyos gének mutációi miatt következik be, mint például a nukleáris faktor kappa B, a szeksztesztoszóma p62 és az oszteoprotegerin. Másrészt az ekcéma a különféle allergénekkel szembeni túlérzékenységi reakciók eredményeként jelentkezik. Ez a patogenezisbeli különbség a fő különbség a két betegség között.
