Fő különbség - Upstream vs Downstream DNS
Fontos, hogy általános ismeretekkel rendelkezzünk a DNS összetételéről és felépítéséről, hogy megértsük a különbséget az upstream és a downstream DNS között. A DNS polinukleotidláncokból áll. A nukleotidok az építõelemek, amelyek polinukleotidláncokat hoznak létre, és mindegyik nukleotid három összetevõbõl áll: öt szénatomszámú cukorból, nitrogénbázisból és foszfátcsoportból. Egy foszfátcsoport és egy OH-csoport kapcsolódik a cukormolekula 5'-helyzetű szénatomjához és egy 3'-helyzetű szénatomhoz egy nukleotidban. A nukleotidokat foszfodiészter kötések kötik össze, amelyek az egyik nukleotid 5'-foszfátcsoportja és a szomszédos nukleotid 3'-OH csoportja között képződnek. Ha egy polinukleotidláncnak van egy szabad 5'-foszfátcsoportja, akkor azt 5'-végként jelöljük meg; ha van szabad 3 'OH csoportja, akkor 3' végként van hozzárendelve. Ezért,A DNS-szálak általában 5'- és 3'-végűek, a polinukleotidláncok végállása szerint. A DNS kettős szálú formában is létezik. Két szál ellentétes egymással. Ezért a DNS-nek két szála van, amelyek 5 '- 3' irány és 3 '- 5' irány felé haladnak. Az upstream és downstream DNS-t az 5'-3 'mRNS-szál transzkripciójára és szintézisére hivatkozva utaljuk. Ha a DNS-t a kódoló szál 5 vége felé tekintjük a transzkripció iniciációs helyétől, akkor azt upstream DNS-nek nevezzük. Ha a DNS-t a transzkripciós iniciációs hely kódoló szálának 3'-vége felé tekintjük, akkor az a downstream DNS. Ez a legfontosabb különbség az upstream és a downstream DNS között. Két szál ellentétes egymással. Ezért a DNS-nek két szála van, amelyek 5 '- 3' irány és 3 '- 5' irány felé haladnak. Az upstream és downstream DNS-t az 5'-3 'mRNS-szál transzkripciójára és szintézisére hivatkozva utaljuk. Ha a DNS-t a kódoló szál 5 vége felé tekintjük a transzkripció iniciációs helyétől, akkor azt upstream DNS-nek nevezzük. Ha a DNS-t a transzkripciós iniciációs hely kódoló szálának 3'-vége felé tekintjük, akkor az a downstream DNS. Ez a legfontosabb különbség az upstream és a downstream DNS között. Két szál ellentétes egymással. Ezért a DNS-nek két szála van, amelyek 5 '- 3' irány és 3 '- 5' irány felé haladnak. Az upstream és downstream DNS-t az 5'-3 'mRNS-szál transzkripciójára és szintézisére hivatkozva utaljuk. Ha a DNS-t a kódoló szál 5 vége felé tekintjük a transzkripció iniciációs helyétől, akkor azt upstream DNS-nek nevezzük. Ha a DNS-t a transzkripciós iniciációs hely kódoló szálának 3'-vége felé tekintjük, akkor az a downstream DNS. Ez a legfontosabb különbség az upstream és a downstream DNS között. Ha a DNS-t a kódoló szál 5 vége felé tekintjük a transzkripció iniciációs helyétől, akkor azt upstream DNS-nek nevezzük. Ha a DNS-t a transzkripciós iniciációs hely kódoló szálának 3'-vége felé tekintjük, akkor az a downstream DNS. Ez a legfontosabb különbség az upstream és a downstream DNS között. Ha a DNS-t a kódoló szál 5 vége felé tekintjük a transzkripció iniciációs helyétől, akkor azt upstream DNS-nek nevezzük. Ha a DNS-t a transzkripciós iniciációs hely kódoló szálának 3'-vége felé tekintjük, akkor az a downstream DNS. Ez a legfontosabb különbség az upstream és a downstream DNS között.
TARTALOM
1. Áttekintés és kulcsfontosságú különbségek
2. Mi a DNS felső szakasza
3. Mi az a DNS alsó szakasza
4. Egymás melletti összehasonlítás - Upstream vs Downstream DNS
5. Összegzés
Mi az Upstream DNS?
A gén egy strukturális és funkcionális egység öröklődés, amely egy szervezet DNS-ein található. A fehérje előállítására vonatkozó utasításokkal együtt tárolják. A génnek van egy meghatározott DNS-molekulájú régiója. Ha szükséges, egy mRNS-szál szintézisével átírja és átalakítja fehérjévé. Normális esetben a gén kódoló szála 5'-től 3'-ig terjed. Átírásakor mRNS-szálat hoz létre ugyanabba az irányba, 5'-től 3'-ig. A transzkripció során 3'-5 'antiszensz szál szolgál templát szálként, és elindítja az mRNS szintézist. Van egy transzkripciós iniciációs hely a génben. A transzkripció iniciációs helyére hivatkozva a kódoló szál 5'-vége felé eső DNS régiót upstream DNS néven ismerjük. A gén promótere általában a DNS upstream régiójában helyezkedik el. Az eukarióta génekbenvannak TATA dobozok, promóter proximális elemek és fokozók a géntől felfelé eső területen. A gén upstream régióját negatív számokkal jelöljük. A transzkripció szempontjából rendkívül fontos egy gén felfelé irányuló DNS-je.
Mi a Downstream DNS?
A transzkripció iniciációs helye egy gén +1 pontja. A DNS-régió a +1 ponttól a kódoló szál 3'-vége felé downstream DNS-ként ismert. Más szavakkal, a géntől lefelé a transzkripció iniciációs helyétől a templát szál 5'-vége felé tart. Ezért egy gén régió downstream DNS-je tartalmaz transzkripciós egységet és más szekvenciákat, például terminátor szekvenciát. A promóter befolyásolhatja egy gén downstream szekvenciáját. A gén lefelé eső részére pozitív számokkal utalunk. A gén downstream DNS-je az a tényleges régió, amely a fehérjeterméket adja.
01. ábra: Upstream és Downstream DNS
Mi a különbség az Upstream és a Downstream DNS között?
Különböző cikk a táblázat előtt
Upstream vs Downstream DNS |
|
| A transzkripció iniciációs helyétől a kódoló szekvencia 5'-vége felé eső DNS régiót upstream DNS néven ismerjük. | A kódoló szál 3'-vége felé eső DNS-régió a transzkripció iniciációs helyétől downstream DNS-ként ismert. |
| Elemek | |
| A promóterek és a fokozók a DNS felső szakaszán találhatók | A transzkripciós egység és a terminátor szekvenciák a downstream DNS-ben találhatók. |
| Számozás | |
| Az upstream régió nukleotidjait negatív számokkal jelöljük | A nukleotidokat pozitív számokkal jelöljük. |
| Funkció | |
| Ez a régió a transzkripció szabályozásához és elindításához szükséges elemeket tartalmaz | Ez a régió tartalmaz utasításokat egy fehérje előállítására és a transzkripció befejezésére |
Összegzés - Upstream vs Downstream DNS
Könnyű azonosítani egy RNS szál felfelé és lefelé. Ami a referenciahelyet illeti, az RNS-szál 5'-vége felé eső régiót upstream RNS-nek, míg a 3'-vég felé vezető régiót downstream RNS-nek nevezzük. A DNS-ben azonban két szál van, amelyek mindkét irányban 5'-től 3'-ig és 3'-tól 5'-ig tartanak. Ennélfogva az upstream és downstream DNS közötti különbség bonyolult. Ezért megkülönböztetik egy gén transzkripciójára való hivatkozással. A transzkripció iniciációs helyétől az sens szál 5 vége felé a DNS régiót upstream DNS néven ismerjük, míg a transzkripció iniciációs helytől az sens szál 3 'vége felé downstream DNS néven ismerjük. Ez a különbség a DNS upstream és downstream között.
