A lineáris és rotációs molekulamotorok közötti fő különbség főleg a motorfehérjét alkotó komplexek mozgása alapján történik. Míg a lineáris molekulamotorok egyirányú lineáris mozgást mutatnak a komplexek között, addig a rotációs molekulamotorok rotációs mozgásokat mutatnak a molekuláris motort alkotó különféle komplexek körül.
A molekulamotorok fontos biomolekulák, amelyek számos reakcióban vesznek részt, különösen az adenozin-trifoszfát (ATP) szempontjából az energiatermeléssel kapcsolatban. Döntő szerepet játszanak a mozgásban vagy a mechanikai munkában. A motorfehérjék az ATP-ből vagy a nukleotid-trifoszfát-hidrolízisből származó szabad energiát használják fel mechanikai erő előállításához. Kétféle molekuláris motor létezik, mint lineáris molekuláris motor és rotációs molekuláris motor. A motor két működési módját képviselik.
