A napfogyatkozás és a látens periódus közötti legfontosabb különbség az, hogy a napfogyatkozási periódus a fágfehérjék és a nukleinsavak szintetizálásának ideje a gazdasejtben, míg a látens periódus a vírusgenom sejtbe történő injektálása és a gazdasejt-lízis között eltelt idő.
A bakteriofág (fág) egy kötelező intracelluláris vírusrészecske, amely egy adott baktériumban fertőz és terjed. Ezeket baktériumevőként is ismerik, mivel baktericid szerként hatnak. A fej és a farok komplex alakja a leggyakoribb forma, amelyet a bakteriofágok mutatnak. Megfertőzik a gazdabaktériumokat a szaporodás érdekében. A fertőzés kezdetén felszíni receptoraik segítségével szorosan kapcsolódnak a baktérium sejtfalához, és genetikai anyagukat a gazdasejtbe fecskendezik. Ekkor fertőzésük két cikluson keresztül történhet: lítikus és lizogén cikluson keresztül.
A lítikus ciklusban a bakteriofágok megfertőzik a baktériumokat, és a lízissel gyorsan elpusztítják a gazda baktérium sejteket. A lizogén ciklusban a vírus genetikai anyaga integrálódik a baktériumok genomjához vagy plazmidjaihoz, és a gazdasejtben sok generáción át létezik, anélkül, hogy a gazda baktériumot elpusztítaná. A fertőzési folyamat különböző periódusokat követ, mint a látens periódus, a napfogyatkozás, az emelkedési periódus stb.
