A legfontosabb különbség az ionotrop és a metabotrop receptorok között az, hogy az ionotrop receptorok lehetővé teszik az ionos ligandumok megkötését hozzájuk, ami megnyitja az ioncsatornát. Eközben a metabotrop receptorok lehetővé teszik a kémiai ligandumok megkötését a receptorokhoz, és egy G-fehérjéhez kapcsolódva elindítják a reakciók kaszkádját.
A jelátvitel és a membrántranszport fontos folyamatok a biológiában. Mindkettő létfontosságú szerepet játszik az anyagcsere szabályozásában a rendszerben. A metabolikus utak többsége és a membrántranszport olyan receptorokon keresztül megy végbe, amelyek ligandumokkal kötődnek, amelyek lehetnek ionos vagy kémiai ligandumok.