Az opszonizáció és a semlegesítés közötti fő különbség az immunológiai válasz végrehajtásának módjától függ. Az opszonizáció során a kórokozókat megsemmisítés előtt jelölik, míg semlegesítéskor a kórokozó hatása semleges.
Az immunológiai válaszok lehetnek veleszületettek vagy adaptívak. A kórokozók kórokozó-felismerő receptorokkal rendelkeznek, amelyek megkönnyítik a gazdaszervezet azonosítását. Az opszonizáció során a gazda opszoninokat állít elő. Semlegesítéskor azonban a gazdaszervezet semlegesítő antitesteket termel az antitest-antigén reakció hatásának semlegesítésére.
