A legfontosabb különbség a ciszta és a spóra között az, hogy a ciszta a baktériumok vagy protozoonok alvó stádiuma, amely megkönnyíti túlélésüket kedvezőtlen környezeti körülmények között, míg a spóra egy reproduktív szerkezet, amely új egyedgé fejlődhet.
A mikroorganizmusok, különösen a baktériumok, különböző struktúrákat, például cisztákat, endoszporákat stb. Termelnek, hogy életben maradjanak és elterjedjenek a különböző környezetekben. A ciszták szunnyadó struktúrák, amelyek elősegítik a túlélést zord környezeti körülmények között. Ez nem reproduktív szerkezet. Ezzel szemben a spóra reproduktív szerkezet, amely új egyedet eredményezhet. A cikk célja a ciszta és a spóra közötti különbség megvitatása.