A legfontosabb különbség az endocitózis és az exocitózis között az, hogy az endocitózis anyagokat juttat a sejtbe, míg az exocitózis az anyagokat a sejt kívülre szállítja.
A sejtnek van egy sejtmembránja, amely gátként működik a sejt belseje és a külső környezet között. Ezért, ha ilyen membránjuk van, a sejteknek valamilyen szállítási mechanizmusra van szükségük ahhoz, hogy kapcsolatba lépjenek a külső környezettel. Például a sejteknek tápanyagokat kell beszerezniük és a hulladékot ki kell választaniuk a sejtből. Ebből a célból a sejteknek négy alapvető szállítási mechanizmusuk van: diffúzió, ozmózis, aktív szállítás és tömeges szállítás. A diffúzió és az ozmózis passzív folyamatok, míg az aktív szállítás és az ömlesztett szállítás aktív folyamatok, amelyek energiát fogyasztanak. Az endocitózis és az exocitózis kétféle tömeges szállítási mechanizmus, amelyek nagy részecskéket szállítanak a plazmamembránon, akár a sejtből a külső környezetbe, akár a külső környezetből a sejtbe. Mindkét mechanizmus a membránhoz kötött vezikulákat képezi a szállítás eszközeként.
