A legfontosabb különbség az episztatikus gén és a hiposztatikus gén között az, hogy az episztatikus gén egy olyan gén, amely befolyásolja egy másik gén expresszióját egy másik lokuszon, míg a hiposztatikus gén az a gén, amely az episztatikus gén interferenciájának van kitéve.
Bizonyos gének kifejeződése más nem allél génektől függ. Az episztázis a gén kölcsönhatásának egy olyan formája, amelyben az egyik gén megzavarja vagy elfedi egy másik gén expresszióját, amely egy másik lokuszban található. Ennélfogva ez egyfajta nem allél gén kölcsönhatás. Ebben a különleges génkölcsönhatásban két gén lép kölcsönhatásba, és ezek az episztatikus gén és a hiposztatikus gén. Ennek megfelelően az a gén, amely más gén expresszióját elfedi, episztatikus génnek, míg az a gén, amelynek expresszióját befolyásolja, hiposztatikus génként ismert.
