A trágya és a szerves anyag közötti legfontosabb különbség az, hogy a trágya egy szerves anyag egyik formája, amelyet ember alkot, míg a szerves anyag a talajban természetesen képződő szénben gazdag vegyületek.
A növények ökoszisztémáinkban a fő őstermelők. Ezért fontosak más állatok táplálékellátásában, és részt vesznek a természetes egyensúly fenntartásában is. A növények táplálékra és vízre is szükségük van a növekedéshez. Az élelem, a víz és az élőhely talajától függenek. Ezért a talajnak egészséges állapotban kell lennie, és szerves anyagokra van szükség a talaj minőségének fenntartásához. A szerves anyagok a szenet tartalmazó vegyületek. A talajban a szerves anyagok számos formája létezik. Ezzel szemben a trágya ember alkotta, és tartalmazza a talaj egészségi állapotának növeléséhez szükséges összes alapvető tápanyagot. Ennek megfelelően a szerves anyagok és a trágya két olyan terminológia, amelyek nagyon fontosak a talajbiológiában és a mezőgazdaságban.
