A legfontosabb különbség az aktív transzport és a passzív transzport között az, hogy az aktív transzport a molekulákat az alacsony koncentrációtól a magas koncentrációig egy féligáteresztő membránon keresztül mozgatja a koncentrációgradiens ellen, míg a passzív transzport a koncentrációgradiens mentén mozgatja a molekulákat a magas koncentrációtól az alacsony koncentrációig. Ezenkívül az aktív transzport energiát igényel a molekuláris mozgásokhoz, ellentétben a passzív transzporttal, amely nem igényel energiát.
Az aktív transzport és a passzív transzport két olyan folyamat, amely leírja a molekulák mozgását az egyik régióból a másikba egy koncentrációgradiens eredményeként. A koncentrációs gradiens a részecskék koncentrációjának fokozatos változása az oldatban két régió között, és gradiens eredményeket ad, ha az ionok egyenlőtlen eloszlása van a sejtmembránon. Tehát, amikor a részecskék mozgásai a koncentrációgradienssel vannak szemben, az aktív transzport, ha pedig a koncentrációgradiens felé, akkor passzív transzport.