A legfontosabb különbség a metalloenzimek és a fém által aktivált enzimek között az, hogy a metalloenzimek kofaktorként szilárdan kötött fémionokkal rendelkeznek, míg a fémaktivált enzimekben lévő fémionok nincsenek szilárdan megkötve.
Egyes enzimek aktivitása a fémionoktól függ, mivel ezek a fémionok kofaktorként működnek. Ezek az enzimek két fő kategóriába sorolhatók, mint a metalloenzimek és a fém által aktivált enzimek. Ezért ezek az enzimek a szorosan kötött fémionok jelenléte vagy hiánya szerint különböznek egymástól. Beszéljünk ezekről az enzimekről.