A fájlrendszer és az adatbázis közötti legfontosabb különbség az, hogy a fájlrendszer csak a fizikai hozzáférést kezeli, míg az adatbázis az adatokhoz való fizikai és logikai hozzáférést is.
Az adatbázis és a fájlrendszer két módszer, amelyek elősegítik az adatok tárolását, visszakeresését, kezelését és manipulálását. Mindkét rendszer lehetővé teszi a felhasználó számára, hogy hasonlóan dolgozzon az adatokkal. A fájlrendszer a merevlemezen tárolt nyers adatfájlok gyűjteménye, míg az adatbázis nagy mennyiségű adat egyszerű szervezésére, tárolására és visszakeresésére szolgál. Más szavakkal, egy adatbázis rendszerezett adatokból álló csomagot tartalmaz, általában digitális formában, egy vagy több felhasználó számára. Az adatbázis rövidítése DB. Lehetőség van a DB osztályozására azok tartalma szerint, például dokumentum-szöveg, bibliográfiai és statisztikai adatok szerint. Fontos megjegyezni, hogy még adatbázisban is az adatok végül vagy fizikailag egyes fájlokban tárolódnak.
