Fő különbség - Exome vs Transcriptome
Egy gén kódoló és nem kódoló régiókat tartalmaz benne. A kódoló szekvenciák exonként, a nem kódoló szekvenciák pedig intronként ismertek. A gén exonjainak nukleotidszekvenciája a gén genetikai kódját képviseli a specifikus fehérje szintetizálásához. Ezért az exonok az mRNS-molekulában maradnak. A genom teljes exon régiója exom néven ismert, és ez a genom fontos része. A gének genetikai kódja átalakul az mRNS molekula genetikai kódjává, amelyre a fehérje termeléséhez van szükség. A sejtekben vagy egy sejtpopulációban egy időben átírt teljes mRNS-molekulák transzkriptómként ismertek. A legfontosabb különbség az exom és a transzkriptóma között az, hogy az exom a genom exonrégióinak szekvenciáit képviseli, míg a transzkriptóm egy adott sejt vagy egy szövet teljes mRNS-ét jelenti egy adott időpontban.
TARTALOM
1. Áttekintés és a legfontosabb különbség
2. Mi az Exome
3. Mi az a Transcriptome
4. Egymás mellett történő összehasonlítás - Exome vs Transcriptome
5. Összegzés
Mi az Exome?
A gének exonokból, intronokból és szabályozó szekvenciákból állnak. Az exonok azok a génrégiók, amelyek a transzkripció során átíródnak mRNS-szekvenciába. Az intronokat és más nem kódoló régiókat eltávolítjuk a transzkripció során. Az exonok nukleotidszekvenciája meghatározza a gén genetikai kódját, amely szintetizálja az általa kódolt specifikus fehérjét. Csak egy fehérje mRNS-jében maradnak exonok. Az exonok gyűjteménye a genomban egy szervezet exomjaként ismert. A genom egy részét képviseli, amelyet gének fejeznek ki. Emberben az exome a genom 1% -át teszi ki. Ez az emberi genom fehérjét kódoló része.
01. ábra: Exome
Mi az a Transcriptome?
A transzkriptóm az összes fehérjét kódoló és nem kódoló transzkriptum (RNS) összegyűjtése egy adott szövetben. A transzkriptóma a sejtekben vagy szövetekben található gének által expresszált összes mRNS-molekula gyűjteményét jelenti. Egy sejt transzkripciója variálható egy másik sejttípus transzkripciójával. Az átírás szintén dinamikus - az idő függvényében változik mind a belső, mind a külső ingerekre reagálva. Még ugyanabban a szövetben vagy ugyanazon sejttípuson belül is, a transzkriptóm néhány perc múlva megváltozhat.
A transzkriptóm különbözik egy szervezet exomjától. Az átírás csak az expresszált exomszekvenciákat tartalmazza. Noha a sejt exomja ugyanaz marad, a transzkriptóma eltér a sejtek között, mivel a génexpresszió nem minden sejt vagy szövet esetében azonos. Csak az alapvető gének expresszálódnak a különböző sejtekben és szövetekben. A génexpresszió szövet- vagy sejttípus-specifikus folyamat. Különböző tényezők szabályozzák, beleértve a környezeti tényezőket is. Ezért a transzkriptóm a külső környezeti feltételektől függően változhat.
A transzkriptómot a proteomikai vizsgálatok előfutáraként használják. Minden fehérje mRNS-szekvenciákból származik. A transzlációs módosítások a fehérjék változását eredményezhetik. A transzkriptóm azonban fontos alapinformációkat nyújt a proteomikai vizsgálatokhoz.
02. ábra: Az embrionális őssejtek transzkripciója
Mi a különbség az Exome és a Transcriptome között?
Különböző cikk a táblázat előtt
Exome vs Transcriptome |
|
| Az Exome a gének fehérjét kódoló régiójának gyűjteménye. | A transzkriptóma az összes átírt RNS, beleértve az mRNS-t is, gyűjteménye. |
| Minta | |
| Az Exome-ot DNS-minta segítségével vizsgálják. | A transzkriptómot RNS-minta segítségével tanulmányozzuk. |
| Tanulmányi módszer | |
| A teljes exome szekvenálás az exome tanulmányozásának módszere. | Az RNS szekvenálás a transzkriptóm tanulmányozásának módszere. |
Összegzés - Exome vs Transcriptome
Az exonok a gének kódoló szekvenciái, és meghatározzák a fehérjék mRNS-szekvenciáit. Ezeknek a kódoló szekvenciáknak (exonoknak) a gyűjteménye egy szervezet exomjaként ismert. A fehérjék előállítása előtt a géneket átírják mRNS-molekulákba. A sejtek vagy szövetek összes mRNS-molekulája az adott időpontban transzkriptóm néven ismert. A transzkriptóm azokat a géneket jelöli, amelyek az adott pillanatban aktívan expresszálódnak mRNS-be. A transzkriptóma sejt- és szövetspecifikus és befolyásolja a környezeti feltételeket. Ez a különbség az exome és az transcriptome között.
