A szelekció stabilizálása és kiegyenlítése között az a legfontosabb különbség, hogy a szelekció stabilizálása egyfajta természetes szelekció, amely a populáció átlagos fenotípusait részesíti előnyben, míg a szelekció kiegyenlítése a gén több alléljának fenntartása egy populációban a genetikai sokféleség fokozása érdekében.
A stabilizáló szelekció a természetes szelekció olyan típusa, amely egy fenotípusos tulajdonságra vonatkozik. A populáció átlagos fenotípusainak kedvez. Ezért megszünteti az extrém fenotípusok mindkét típusát. Végül egységes népességet alkot. A szelekció kiegyensúlyozása számos olyan szelektív folyamat, amely egy gén több alléljának fenntartásával fenntartja az előnyös genetikai sokféleséget a populációban. Ezért egy gén lokuszra vonatkozik.