A legfontosabb különbség a homonukleáris és a heteronukleáris aromás vegyületek között az, hogy a homonukleáris aromás vegyületek azonos vegyi elemek atomjait tartalmazzák a gyűrű szerkezetében, míg a heteronukleáris aromás vegyületek különböző kémiai elemek atomjait tartalmazzák a gyűrű szerkezetében.
A homonukleáris és heteronukleáris aromás vegyületek gyűrűs szerkezetet tartalmazó szerves vegyületek. Ezek a gyűrűs szerkezetek vagy azonos atomokat, vagy különböző atomokat tartalmaznak. Ezért különböző kémiai és fizikai tulajdonságokkal rendelkeznek, a gyűrűs szerkezetek atomjainak típusától függően.