A legfontosabb különbség a radioaktív és a nem radioaktív szondák között az, hogy a radioaktív próbák egyszálú DNS- vagy RNS-szekvenciák, amelyeket radioaktív izotópokkal jelölnek, míg a nemrádióaktív próbák egyszálú DNS- vagy RNS-szekvenciák, amelyeket kémiai címkével vagy fluoreszcens jelöléssel jelölnek.
A nukleinsavhibridizáció fontos technika a molekuláris biológiában, különösen a mikrobiális diagnosztikában. Segít egy adott nukleinsavszekvencia azonosításában vagy detektálásában. Ebben a technikában a nukleinsavakat szilárd felülethez rögzítik és hibridizálják egy próbával. A próba a DNS vagy RNS fragmense, amely komplementer egy érdekes szekvenciával. Ha a célszekvencia jelen van a mintában, a próba hibridizálódik vele, és kimutathatóvá teszi. Kétféle szonda létezik, mint radioaktív és nem radioaktív szonda. Ezért a szondákat radioaktív címkével vagy fluoreszcens címkével jelölhetjük meg.