A feszültség-kapu és a ligandum-kapu ioncsatornák közötti legfontosabb különbség az, hogy a feszültség-kapuzott ioncsatornák feszültségkülönbségre válaszul nyílnak meg, míg a ligandum-kapuzott csatornák egy ligandum-kötődésre válaszul nyílnak meg.
A membrántranszport fontos mechanizmus, amely lehetővé teszi az ionok bejutását és felszabadítását. Így az ioncsatornák fontos molekulák, amelyek elősegítik a membrán transzportját. Ennek ellenére az ioncsatornák nagy része beágyazódik a sejtmembránba, és ezek fehérjék. Egyesek azonban lehetnek csatornafehérjék, míg mások hordozók. A csatornaproteinek kétféle típusúak; zárt csatornák vagy nem zárt csatornák. A kapuzott ioncsatornák háromféle; mégpedig feszültség-kapu, ligandum-kapu és stressz-aktivált ioncsatornák. Mindkét csatorna belépő oldala zártként létezik, és csak meghatározott feltételek mellett nyílnak meg.