A legfontosabb különbség a glikogén és a glükóz között az, hogy a glikogén egy olyan poliszacharid, amely szénhidrátokat tárol az állatokban és a gombákban, míg a glükóz a leggyakoribb monoszacharid, amely a sejtek elsődleges energiaforrásaként működik.
A szénhidrátok olyan szerves vegyületek, amelyek szén-, hidrogén- és oxigénelemekkel rendelkeznek. A hidrogén és az oxigén aránya a szénhidrátokban 2: 1, hasonlóan a vízhez. A szénhidrátok nagyon fontos elterjedt biológiai vegyületek, mivel ezek a fő energiaforrás és a protoplazma szerkezeti alkotóelemei. A szénhidrátok általában fehérek, szilárdak és oldhatók szerves folyadékokban, kivéve bizonyos poliszacharidokat. A monoszacharidok a szénhidrátmolekulák alapegységei, és ezek közül a glükóz a legfontosabb. A glikogén szintén szénhidrát. De ez egy poliszacharid, amelyet a glükózmolekulák elágazó molekulává történő anabolizmusa képez. A glükóz és a glikogén egyaránt fontos a test energiatermelésében. A glükóz az energiatermelés fő üzemanyaga, a glikogén pedig egyfajta másodlagos,hosszú távú energiatárolás állatokban és gombákban.
