A legfontosabb különbség az interspecifikus és az intraspecifikus hibridizáció között az, hogy az interspecifikus hibridizáció két rokon, két különböző fajhoz tartozó egyed között következik be, míg az intraspecifikus hibridizáció ugyanazon faj genetikailag divergens két egyede között következik be.
A hibridizáció a genetikailag differenciált egyének vagy csoportok párzási vagy keresztezési folyamata. A hibridizáció fő célja a különböző organizmusokban jelenlévő kívánatos gének egyesítése. Ezenkívül a hibridizációt a tiszta tenyésztésű utódok előállítására használják. A párosítás történhet ugyanazon faj két egyede vagy a különböző fajok két egyede között. Ennek alapján a hibridizációnak két típusa van: intraspecifikus hibridizáció és interspecifikus hibridizáció.