A legfontosabb különbség a citoplazmatikus öröklődés és a nukleáris öröklés között az, hogy a citoplazmatikus öröklődés a citoplazmatikus organellumokban jelen lévő génekből származik, míg a nukleáris öröklődés a kromoszómákon található génekből származik.
A megtermékenyítés a férfi és női ivarsejtek fúziója. Ezért a megtermékenyítés során a haploid sperma és a haploid petesejt egyesül és diploid zigótát képez. A spermasejt magját a petesejtbe helyezi át a fúzió érdekében. A kapott zigótának a petesejt citoplazmája van. Egyszerű szavakkal, a petesejt citoplazmája a zigóta citoplazmájává válik. Sőt, az utódok mind az anyai citoplazmatikus organellumok magjaiból, mind génjeiből kapnak gént. A sejtmagok és a citoplazmatikus organellák génjeit az utódok öröklik. Ezért a nemi megtermékenyítés során kétféle öröklődés fordul elő. Ezek citoplazmatikus öröklődés és nukleáris öröklődés.
