A legfontosabb különbség a kariotípus és az idiogram között az, hogy a kariotípus a sejt teljes kromoszómájának tényleges képe, míg az idiogram a kariotípus sematikus diagramja, amely az összes kromoszómatérképet szemlélteti.
A kromoszómák egy csoportja képviseli egy szervezet genomját és genetikai információit. Minden kromoszómának egyedi alakja, mérete és génkészlete van. A kromoszómák száma és fizikai szerkezete fontos információkat tár fel a szervezetre vonatkozóan. A kariotipizálás a kromoszómák teljes sorozatának vizsgálatára szolgáló technika. Az összes kromoszómát összegyűjtjük és elemezzük a teszt során annak megállapítására, hogy vannak-e numerikus vagy strukturális eltérések a kromoszómákban. A tényleges kép, amely a sejt teljes kromoszómáját mutatja, a kariotípus, míg a sejt teljes kromoszómájának sematikus diagramja az idiogram. Mindkettő fontos a citogenetikai vizsgálatokban.
