A legfontosabb különbség a puskás szekvenálás és a következő generációs szekvenálás között az, hogy a puskás szekvenálás olyan szekvenálási módszer, amely véletlenszerűen bontja fel a DNS szekvenciákat sok apró fragmentumra, és az átfedő régiók megfigyelésével állítja össze újra a szekvenciát, míg a következő Next Generation Sequencing (NGS) egy fejlett módszer genetikai szekvenálás, amely a kapilláris elektroforézistől függ.
A szekvenálás az a folyamat, amely meghatározza a nukleotidok pontos sorrendjét egy génben, egy géncsoportban, kromoszómában és egy teljes genomban. Nagyon fontos a genomikai vizsgálatokban, az igazságügyi vizsgálatokban, a virológiában, a biológiai szisztematikában, az orvosi diagnózisban, a biotechnológiában és számos más területen a gének szerkezetének és működésének, valamint az organizmusok azonosításának elemzése. Ezenkívül különböző típusú szekvenálási módszerek állnak rendelkezésre. A sörétes szekvencia és az új generációs szekvencia két fejlett módszer közöttük.
