A legfontosabb különbség a hierarchikus és a teljes genom sörétes puskás szekvenálása között az, hogy a hierarchikus sörétes puskák szekvenálásakor a genom a szekvenálás előtt nagyobb töredékekre van felosztva, míg a teljes genom sörétes puskák szekvenálásakor az egész genom apró töredékekre van bontva a szekvenáláshoz.
A szekvenálás fontos módszer a molekuláris folyamatokban, különösen a fajok pontos azonosításában. Valójában ez a génben vagy genomban található nukleotidok pontos sorrendjének azonosításának technikája. A szekvenáláshoz számos technika létezik. Ezek közé tartozik a Maxam Gilbert-módszer, a Sanger-módszer és az automatizált Sanger-módszer.
