A fő különbség a fagocitózis és a pinocitózis között az, hogy a fagocitózis az endocitózis egy olyan formája, amely a szilárd anyagokat a plazmamembránon keresztül juttatja a sejtbe, míg a pinocitózis az endocitózis egy másik formája, amely folyadékokat, beleértve az oldott anyagokat és a kis molekulákat, a plazmamembránon keresztül juttatja a sejtbe.
Az endocitózis egy olyan mechanizmus, amellyel a sejtek makromolekulákat és más szuszpendált részecskéket vesznek be, beleértve a sejtrészeket, makromolekuláris aggregátumokat és idegen részecskéket a sejtbe. Az exocitózis az endocitózis ellentétes mechanizmusa, amely révén a sejtek kizárják az anyagokat a sejtekből. Az exocitózis főként szekréciós sejtekben történik. Az endocitózisnak két típusa van, az élő sejtekbe kerülő részecskék jellege alapján. Ezek fagocitózis és pinocitózis. A mindkét folyamatban alkalmazott mechanizmus ugyanaz. Vízikulákat képeznek, amelyek körülveszik az anyagokat annak érdekében, hogy bejussanak. Mindkét folyamat aktív folyamat. Ezért megfigyelheti a mitokondriumokat azon felületek közelében, ahol ezek a folyamatok bekövetkeznek.
