A legfontosabb különbség az amfolit és az amfoter között az, hogy az amfoter kifejezés azt jelenti, hogy egy molekula képes savként vagy bázisként működni, míg az amfolit egy amfoter molekula.
Olyan molekulákkal találkozunk, amelyeket bázikusnak, savasnak vagy semlegesnek minősítünk. Az alapoldatok pH-értéke 7-nél magasabb, a savas oldatok pH-értéke pedig 7-nél alacsonyabb. A 7-es pH-értékű oldatok semleges oldatok. Vannak olyan molekulák, amelyek eltérnek ettől a normál kategorizálástól. Az amfolitok egy ilyen molekula. Savas és bázikus kémiai természetük is van.