A legfontosabb különbség a hidrofób és hidrofil aminosavak között az, hogy a hidrofób aminosavak nem polárosak, míg a hidrofil aminosavak polárosak.
Az aminosavak a fehérjék építőkövei. A fehérje egy óriási polimer molekula, amely minden élő szervezet alapvető eleme. Ezenkívül az aminosavak főleg kétféle, esszenciális és nem esszenciális aminosavak. Ezenkívül hidrofil és hidrofób aminosavakként kategorizálhatjuk őket, a fizikai-kémiai jellegüktől függően. Elsősorban a polaritás alapján különböznek egymástól.