A szerves és szervetlen nitrogén közötti legfontosabb különbség az, hogy a szerves nitrogén a szerves vegyületekben előforduló nitrogén, míg a szervetlen nitrogén a szervetlen vegyületekben előforduló nitrogén.
A szerves vegyületek olyan vegyi anyagok, amelyek nélkülözhetetlen komponensként C- és H-atomokat tartalmaznak. Ha ezek a vegyületek nitrogént is tartalmaznak, ez a nitrogén szerves nitrogén. A szervetlen vegyületek olyan vegyi anyagok, amelyeknek a szénen és a hidrogénen kívül más kémiai elemei vannak. De szervetlen vegyületekben is lehet szén és hidrogén. Nem szükséges azonban ezeknek a kémiai elemeknek a megléte, mint a szerves vegyületeknél. Ekkor az ezekhez a vegyületekhez kötött nitrogénatomok szervetlen nitrogénatomok. Ezeket a kifejezéseket elsősorban a talajkémia vonatkozásában használjuk.
