A legfontosabb különbség az egyszerű fehérje és a konjugált fehérje között az, hogy az egyszerű fehérjék olyan aminosavakból készülnek, amelyek össze vannak kötve egy nagy molekula képződésével, míg a konjugált fehérjék összetett molekulák, amelyek egyszerű fehérjéket és nem fehérje komponenseket tartalmaznak.
A fehérje egy biopolimer molekula. Azt jelenti; egy fehérjemolekula számos ismétlődő egységet tartalmaz, amelyek kovalens kötésekhez vannak kötve. Ezek az ismétlődő egységek a fehérje képződéséhez használt aminosavakat jelentik. A fehérjék kémiai összetétele szerint kétféle fehérje létezik, mint egyszerű fehérjék és konjugált fehérjék.