A legfontosabb különbség a homozigóta és a hemizigóta között az, hogy a homozigóta az az állapot, amelyben a diploid organizmus mindkét allélje azonos, míg a hemizigóta az az állapot, amelyben csak egy allél van jelen.
A gének allélként vagy másolatként léteznek. Általában egy génnek két allélje van. Az allél egy gén olyan változata, amely megkülönböztethető fenotípusos hatást eredményez. Az allélek lehetnek dominánsak vagy recesszívek. A domináns allélek teljes mértékben kifejeződnek a fenotípusban, míg a recesszív allélek nem mutatják a fenotípust, ha domináns allélokkal rendelkeznek. A homozigóta, a heterozigóta, a hemizigóta és a nullizigóta különböző zigozitásszintek. A homozigóta az az állapot, amikor hasonló allélok vannak, vagy két domináns allél, vagy két recesszív allél. Hemizigóta az az állapot, amikor egy génnek csak egy példánya vagy allélja van.
