A legfontosabb különbség a kisagy és a kisagy között az, hogy a kisagy az előagy legnagyobb része, míg a kisagy a hátsó agy legnagyobb része.
A gerincesek idegrendszere három fő rendszerből áll: központi idegrendszerből, perifériás idegrendszerből és autonóm idegrendszerből. A központi idegrendszer két fő részből áll: agyból és gerincvelőből. A kisagy és a kisagy az emberi agy két fő része. A kisagy azonban az előagyhoz, míg a kisagy a hátsó agyhoz tartozik. Ez a cikk elsősorban a kisagy és a kisagy közötti különbségre összpontosít.