A legfontosabb különbség az E. coli és a Klebsiella között az, hogy az E. coli egy gram-negatív rúd alakú baktérium, amely mozgékony, míg a Klebsiella a gram-negatív rúd alakú baktériumok nemzetsége, amely nem mozog.
Az Escherichia és a Klebsiella a coliform baktériumok két gyakori nemzetsége. Mindkét nemzetség gram-negatív, rúd alakú, nem spóraképző baktériumokból áll. Az E. coli az Escherichia egyik faja. Mozgékony fekális coliform baktérium. Az E. coli és a Klebsiella baktériumok egyaránt az Enterobacteriaceae családba tartoznak. A bélünk normális flórájának részei. Továbbá fakultatív anaerobok. Mindkettő általában ártalmatlan, de bizonyos helyzetekben opportunista emberi kórokozókká válnak.