A legfontosabb különbség a fukoidán és a fukoxantin között az, hogy a fukoidán egy fukóztartalmú szulfatált poliszacharid, amely a barna alga és a barna hínár különféle fajaiban van jelen, míg a fukoxantin egy xantofill, amely kiegészítő pigmentként van jelen a barna algák és más heterokonttok kloroplasztjaiban.
A tengeri ökoszisztémák mind növény-, mind állatvilágot alkotnak. Nagy a fajok sokfélesége. Sőt, ezek a fajok különböző vegyületeket tartalmaznak, amelyek előnyösek az ember számára. Az ezekből a fajokból a tengeri ökoszisztémákban kivont biomolekulák különböző terápiás potenciállal rendelkeznek. A fukoidán és a fukoxantin két ilyen vegyület van jelen a tengeri ökoszisztémákban, főleg a barna algákban. Annak ellenére, hogy kémiailag különböznek egymástól, mindkét vegyületet jelenleg különböző kutatási célokra használják, hogy azonosítsák terápiás lehetőségeiket.