A rezonancia és a mezomer hatás közötti legfontosabb különbség az, hogy a rezonancia a magányos elektronpárok és a kötő elektronpárok közötti kölcsönhatás eredménye, míg a mezomer hatás szubsztituens csoportok vagy funkcionális csoportok jelenléte miatt következik be.
A rezonancia és a mezomer hatás két kémiai fogalma meghatározza egy szerves molekula pontos kémiai szerkezetét. A rezonancia olyan molekulákban keletkezik, amelyekben a molekula bármely atomján egyedüli elektronpárok találhatók. A mezomer hatás akkor lép fel, ha egy molekulának vannak szubsztituensei vagy funkcionális csoportjai. Mindkét jelenség gyakori a szerves molekulákban.
