Kulcskülönbség - VNTR vs STR
A DNS-vizsgálatok rendkívül hasznosak a filogenetikai kapcsolatok megértésében és meghatározásában, a genetikai betegségek diagnosztizálásában és a szervezet genomjának feltérképezésében. Számos DNS-elemzéshez kapcsolódó technikát alkalmaznak egy adott gén vagy egy DNS-szekvencia azonosítására ismeretlen DNS-készletben. Genetikai markerekként ismertek. A molekuláris biológiában genetikai markerekkel azonosítják az egyének és fajok közötti genetikai variációt. A változó számú tandemismétlés (VNTR) és a rövid tandemismétlés (STR) kétféle genetikai marker, amelyek polimorfizmust mutatnak az egyének között. Mindkét típus nem kódoló, ismétlődő DNS, amelyek tandem ismétlődések. A kromoszómákban fej-farok formában vannak elrendezve. A VNTR a genom azon szakasza, ahol a rövid nukleotidszekvenciát többször megismétlik. Az STR a DNS egy másik szakasza a genomban, amely százszor kétszer-tizenhárom nukleotidból álló ismétlődő egységekként szerveződik. A legfontosabb különbség a VNTR és az STR között az ismétlődő szekvenciák nukleotidjainak száma. A VNTR ismétlődő egységei 10-100 nukleotidot tartalmaznak, míg az STR ismétlődő egysége 2-13 nukleotidot tartalmaz. A VNTR-t és az STR-t széles körben használják az igazságügyi vizsgálatokban.
TARTALOM
1. Áttekintés és legfontosabb különbségek
2. Mi a VNTR
3. Mi az STR
4. A VNTR és az STR közötti hasonlóság
5. Egymás melletti összehasonlítás - VNTR vs STR táblázatos formában
6. Összefoglalás
Mi az a VNTR?
A tandem ismétlés a DNS rövid szekvenciája, amelyet fej-fark formában ismételnek meg egy adott kromoszómális lokuszon. Nincs más szekvencia vagy nukleotid a tandem ismétlésen belül. A genomban többféle tandemismétlés létezik. A VNTR egyfajta tandem ismétlés, amely 10-100 nukleotidból álló ismétlődő egységeket tartalmaz. A VNTR egyfajta minisatellit. Ezek a tandemismétlések sok kromoszómában megtalálhatók. Ezek az emberi genomban helyezkednek el, és főleg a kromoszómák szubtelomer régióiban helyezkednek el.
A VNTR-ek tandem ismétlődő polimorfizmust mutatnak az egyének között. A VNTR hossza a kromoszóma egy adott helyén nagyon változó az egyének között, az abban a DNS szakaszban szerveződő ismétlődő egységek számának változása miatt. Ezért a VNTR hatékony eszközként használható az egyének azonosításában, és a VNTR elemzést számos területen alkalmazzák, beleértve a genetikát, a biológiai kutatásokat, az igazságügyi orvostechnikát és a DNS-ujjlenyomatot. A VNTR-k voltak az első genetikai markerek, amelyeket a csontvelő-transzplantáció beültetésének számszerűsítésére használtak. A VNTR-k voltak az első polimorf markerek, amelyeket a kriminalisztikai DNS-profilalkotásban használtak.
01. ábra: A VNTR-ek variációja hat személynél
A VNTR analízist restrikciós fragmens hosszának polimorfizmusával, majd déli hibridizációval hajtjuk végre. Ezért viszonylag nagy DNS-mintára van szüksége. A VNTR profilértelmezése szintén problematikus. Ezen korlátozások miatt a VNTR használata az igazságügyi genetikában korlátozott volt, és helyébe STR elemzés lépett.
Mi az STR?
Az STR egy nagyon ismétlődő DNS szakasz, amely két-tizenhárom nukleotid ismétlődő egységből áll, tandem módon szerveződve. Az STR hasonló a VNTR-hez. De eltér a VNTR-től az ismétlődő szekvenciában lévő nukleotidok számától és az ismétlések számától. Az STR egyfajta mikroszatellit.
STR elemzés részt vesz az ismétlődő egységek pontos számának mérésében. Az STR-ek nagyon változatosak az egyének között, hasonlóan a VNT-khez. Az STR profilok személyenként eltérőek. Ezért a molekuláris biológiában STR-analízist alkalmaznak a specifikus lokuszok összehasonlítására két vagy több minta DNS-jén. Ezért az STR-eket a molekuláris biológiában erőteljes genetikai markereknek tekintik. Kiváló eszközt nyújt az egyének azonosítására, mivel magas a polimorfizmusuk és viszonylag rövidek.
Jelenleg az STR-ek a leggyakrabban használt elemzett genetikai polimorfizmus eszközei a törvényszéki genetikában. A legtöbb törvényszéki esetmunka STR polimorf elemzést tartalmaz. Az STR lokuszok az egész genomban elterjedtek. A kromoszómákban több ezer STR található, amelyek felhasználhatók az igazságügyi elemzéshez. Az STR elemzés nem tartalmaz restrikciós hosszúságú polimorfizmust, mint a VNTR elemzés. Az STR elemzés nem vágja le a DNS-t restrikciós enzimekkel. Specifikus próbákat használunk a kívánt régiók DNS-hez való rögzítésére és PCR technika alkalmazásával meghatározzuk az STR hosszát.
02. ábra: A minták közötti STR-variáció
Milyen hasonlóságok vannak a VNTR és az STR között?
- A VNTR és az STR nem kódoló DNS.
- Mindkettő tandem ismétlés.
- Mindkettő polimorfizmust mutat az egyének között, a DNS szakasz hosszának különbsége miatt.
- Mindkettőt erőteljes genetikai markerként használják a DNS-ujjlenyomatban és az igazságügyi vizsgálatokban.
Mi a különbség a VNTR és az STR között?
Különböző cikk a táblázat előtt
VNTR vs STR |
|
| A VNTR egy nem kódoló, ismétlődő DNS, amelynek rövid nukleotidszekvenciája tandem módon megismétlődik. | Az STR egy nagyon ismétlődő DNS szakasz, amely két-tizenhárom nukleotid ismétlődő egységből áll, tandem módon szerveződve. |
| Méret | |
| A VNTR-ek nagyobbak, mint az STR-ek. | Az STR-ek kisebbek, mint a VNTR-ek. |
| A nukleotidok száma az ismétlődő szekvenciában | |
| A VNTR ismétlődő egysége 10-100 nukleotidból áll. | Az STR ismétlődő egysége 2-13 nukleotidból áll. |
Összegzés - VNTR vs STR
A VNTR és az STR a molekuláris biológiában használt két hatalmas genetikai marker, különösen a törvényszéki genetika területén. A VNTR egyfajta miniszatellit, az STR pedig egy mikroszatellit. A VNTR és az STR nem kódoló, erősen ismétlődő DNS. Tandem ismétlések. A VNTR és az STR általános szerkezete megegyezik. Ugyanakkor az ismétlődő szekvenciában lévő nukleotidok száma és hossza eltér. A VNTR ismétlődő szekvenciái 10-100 nukleotidból állnak. Az STR ismétlődő szekvenciái 2-13 nukleotidból állnak. Ez a különbség a VNTR és az STR között.
A VNTR vs STR PDF verziójának letöltése
A cikk PDF-verzióját letöltheti, és offline célokra használhatja, az idézőjegyzetek szerint. Töltse le a PDF verziót itt. Különbség a VNTR és az STR között.
