Fő különbség - Genotipizálás és szekvenálás
A genotipizálás és a szekvenálás két módszer, amelyekkel információt nyernek a nukleinsavakról, elsősorban egy szervezet DNS-ről. A legfontosabb különbség a genotipizálás és a szekvenálás között az, hogy a genotipizálás az a folyamat, amelynek segítségével marker segítségével meghatározhatjuk, hogy az egyén melyik genetikai variánssal rendelkezik, míg a szekvenálás a DNS adott fragmentumán belül a nukleotidszekvencia helyes sorrendjének meghatározása.
TARTALOM
1. Áttekintés és kulcsfontosságú különbségek
2. Mi a genotipizálás
3. Mi a szekvenálás
4. Egymás melletti összehasonlítás - Genotipizálás és szekvenálás
5. Összefoglalás
Mi a genotipizálás?
A genotipizálás az egyén genetikai összetételének meghatározása egy DNS és markerek szekvenciájának felhasználásával, valamint annak örökségének összehasonlítása és azonosítása. A genotipizálás fontos az evolúciós biológiában, a populációbiológiában, a taxonómiában, az ökológiában és az élőlények genetikájában. Különböző technikákkal hajtható végre, ideértve a DNS-szekvenálást, a polimeráz láncreakciót, a restrikciós fragmens hosszának polimorfizmusát (RFLP), a véletlenszerű amplifikált polimorf detektálást, az amplifikált fragmens hosszúságú polimorfizmust (AFLP), a DNS mikrosávokat stb.
A genotipizálás magában foglalja a DNS-szekvenciák bizonyos kis töredékeinek szekvenálását és a genetikai összetétel rokonságának megállapítását más egyénekkel genetikai markerek segítségével. Meghatározza az egyének vagy a specifikus allélek közötti egyetlen nukleotid polimorfizmust (SNP). A genotipizálás sokféle organizmusra alkalmazható, ideértve az embereket is. Alkalmazható mikroorganizmusokra, például vírusokra, gombákra stb., És felhasználható genetikai változataik meghatározására a referenciaprofilokkal. A molekuláris epidemiológiában és az igazságügyi mikrobiológiában a kórokozók, különösen a mikroorganizmusok szabályozását a genotipizálás során nyert információkkal végzik. A genotipizálás nagyon fontos a törzskönyv elemzésében. Az emberek genotípusa az anyaság és az apaság megerősítése. A genotípus feltárja a gének domináns és recesszív alléljait, amelyek meghatározzák a specifikus tulajdonságokat.
_1 ábra: RFLP genotipizálás
Mi a szekvenálás?
A szekvenálás a DNS vagy RNS adott fragmensében található nukleotid helyes sorrendjének meghatározása. Gyakorlatilag minden információ, amely egy szervezet növekedéséhez és fejlődéséhez szükséges, a genomjába van kódolva. A néhány száz nukleotid hosszú nukleinsavfragmensek előállítására és elválasztására szolgáló technikák rendelkezésre állása olyan eljárások kifejlesztéséhez vezetett, amelyek meghatározták a DNS vagy RNS adott fragmensének pontos nukleotidszekvenciáját. Különböző típusú szekvenálási módszerek állnak ma rendelkezésre. Ezek a szekvenálási módszerek, valamint a szervezet teljes genomját reprezentáló genom könyvtárak létrehozásának technológiái megkönnyítik az adott szervezet teljes genomjának szekvenálását, mélyreható elemzést végezve a génszerkezetekről, a génfunkciókról, a gének helyéről, a génexpresszióról, géntérkép, génszabályozó régiók stb.
Számos vírus, több baktérium, archaebaktérium, élesztő és néhány más szervezet teljes genomját szekvenálták és feltérképezték. Az emberi genom projekt lehetővé tette az egész emberi genom szekvenálását és feltérképezését, valamint első tervezetének 2003-ban történő közzétételét. Ez a mérföldkő a biológia fejlődésében. Az emberi genom szekvenciákat ma az orvosi szektorban használják a ritka betegségek genetikai okainak azonosítására, az újszülöttek betegségének kockázatának kiszűrésére, a különböző rákok genetikai részleteinek azonosítására, új terápiás gyógyszerek kidolgozására és új diagnosztikai eszközök kifejlesztésére stb.
A növényvilágban a rizs és az Arabidopsis genomokat szekvenálták. E szekvenciák ismerete kétségtelenül forradalmasítja a sejtek és organizmusok működésének megértését.
_2 ábra: Sanger szekvenálás autoradiográfiája
Mi a különbség a genotipizálás és a szekvenálás között?
Különböző cikk a táblázat előtt
Genotipizálás és szekvenálás |
|
| A genotipizálás az egyén genetikai összetételének meghatározására és az adott szervezet csoportjának vagy taxonómiájának ellenőrzésére szolgáló folyamat. | A szekvenálás az adott DNS vagy RNS fragmens nukleotidjainak pontos sorrendjének meghatározása. |
| Technikák | |
| RFLP, génszekvenálás, PCR, DNS mikrorayák, AFLP stb. | Sanger szekvenálás, Gilbert szekvencia, Pyrosequencing, Next Generation szekvencia, Shotgun szekvencia stb. |
| Major aggodalmak | |
| Ez inkább azon aggódik, hogy a genotípus különbségek adják-e a tényleges fenotípus különbségeket. | Ez jobban aggódik a nukleotidok sorrendjéért, valamint annak különbségeiről és változásairól más szervezetekkel szemben. |
Összegzés - Genotipizálás és szekvenálás
A genotipizálás és a szekvenálás hasznos az organizmusok genetikai információinak tanulmányozásához. A genotipizálás az a folyamat, amelynek során meghatározzák az egyének közötti genotípus-variációkat és megtalálják kategóriáikat. A szekvenálás a nukleotidok helyes sorrendjének meghatározása az érdekelt fragmensben vagy a DNS régiójában. Mindkét technika fontos információt nyújt a génekről és a genomokról.
