Transposon vs Retrotransposon
A transzpozonok és a retrotranszpozonok a DNS genetikai összetevői, és közöttük jelentős különbségek vannak. Ezeknek a genetikai anyagoknak a százalékos jelenléte fajonként változó, és funkcióik meghatározzák a szervezet sorsát mutációkkal és más, fenotípusosan fontos változásokkal. A transzpozonok és a retrotranszpozonok bizonyos gének génjei vagy gyűjteményei, amelyek a DNS szálakban helyezkednek el, és ezek helyének megváltoztatása volt a fő oka ezeknek a következményeknek. Ez a cikk azonban röviden megvitatni kívánja e gének funkcióit, és összehasonlítást mutat be a transzpozonok és a retrotranszpozonok között.
Mi az a Transposon?
A transzpozonok a DNS érdekes töredékei vagy szegmensei, amelyek képesek megváltoztatni a DNS-szál elhelyezkedését vágási és beillesztési mechanizmus formájában. A transzpozonok ilyen mobil jellege miatt ezeket ugró géneknek nevezik. A transzpozonok két fő típusba sorolhatók: I. osztályú transzpozonok és II. Osztályú transzpozonok. Általában a II. Osztályt transzpozonoknak, az I. osztályt retrotranszponoknak nevezik. A mobil DNS-szegmensek vágási és beillesztési folyamatait a transzpozáz enzim szabályozza. Az enzim a transzpozon mindkét végéhez kötődik, és elvágja a DNS-szál foszfodiészter kötéseit, izolálja a transzpozont, áthelyezi a célhelyre és megköti az új helyet. Ezt a folyamatot azonban érdekes megérteni,mivel egyes transzpozonok csak bizonyos helyekre költözhetnek csak az alapszekvenciák és a célhely inkompatibilitása miatt. Az egyetlen szál egyik végével rendelkező gének azonos bázissorrenddel rendelkeznek, míg a másik egyetlen szál másik vége ragacsos élű transzpozon, mivel ezek ugyanazon a bázissorrenddel kötődhetnek a cél DNS-szál helyeihez, mint a ragacsos végeken.. Ez a gének mobilitása azonban a genotípus, valamint a szervezet fenotípusának változását okozhatja. A transzpozonokról, a géntechnológiával módosított élelmiszerekről és organizmusokról a tudósok kitalálták a preferált testreszabás szerint. Rendkívül produktív mezőgazdasági növények, gyógyhatású antibiotikumok,az állatállatok voltak az előnyösen kifejlesztett termékek, miután Barbara McClintock az 1940-es években feltalálta a transzpozonokat.
Mi a Retrotransposon?
A retrotranszpozonok az I. osztályú transzpozonok, ezek a másolás és beillesztés mechanizmusán keresztül mozognak a genomban. A retrotranszpozonok mobilitásának mechanizmusa néhány fő lépést foglal magában, mint például a DNS-szál génszegmensének másolása RNS-be, az RNS-kópia átvitele a célhelyre, az RNS-szekvencia visszaírása a DNS-be reverz transzkriptáz segítségével és inszerció a génnek a genom DNS-szálának új helyére. Ezeknek a retrotranszpozonoknak a két végén általában hosszú terminális ismétlődések vannak, körülbelül 1000 bázispárral, és ezeket használják a gének azonosító jellemzőiként. Ezek a gének könnyen amplifikálhatók a genomban, és a retrotranszpozonok százaléka az emberi genomban körülbelül 50%. Ezek meglehetősen veszélyesek lehetnek, mivel az AIDS, a HIV, aés a T-sejtes leukémia vírus retrotranszpozonjai vannak RNS genomjukban. Valójában ezek a vírusok reverz transzkriptáz és integráz alkalmazásával megköthetik a retrotranszpozonokat az emberi DNS-szálak bármelyik helyére. Az integráz enzim ugyanúgy működik, mint a transzpozáz a II. Osztályú transzpozonokban.
Mi a különbség a Transposon és a Retrotransposon között?
• A transzpozonok a II. Osztályú ugró gének, míg a retrotranszponok az I. osztályba tartoznak.
• A transzpozonok a transzpozáz enzimmel, míg a retrotranszpozonok két fő enzim, reverz transzkriptáz és integráz alkalmazásával működnek.
• A terminális végek sokkal hosszabbak a retrotranszpozonokban, mint a transzpozonokban.
• A transzpozonokat levágják az eredetről és a célba illesztik; fordítva, a retrotranszpozonok az origóból az RNS-be másolódnak és a célponton átíródnak.
• A retrotranszpozonok mozgatása magában foglalja az RNS-t, de nem a transzpozonokban.
