Tartalomjegyzék:
- Fő különbség - Microarray vs Next Generation Squencing
- Mi az a Microarray?
- Mi az új generációs szekvencia?
- Mi a hasonlóság a Microarray és az új generációs szekvenciák között?
- Mi a különbség a Microarray és az új generációs szekvenciák között?
- Összegzés - Microarray vs Next Generation Sequencing
2024 Szerző: Mildred Bawerman | [email protected]. Utoljára módosítva: 2023-12-16 08:39
Fő különbség - Microarray vs Next Generation Squencing
A DNS-szekvenálási folyamatokat széles körben alkalmazzák a biotechnológia, a virológia, az orvosi diagnózis és az igazságügyi tudományok területén. Ez egy olyan folyamat, amely meghatározza a DNS-molekulában jelenlévő nukleotidok, adenin, guanin, timin és citozin pontos sorrendjét. A DNS-szekvenálási eljárások az orvosi és biológiai kutatások csodálatos felfedezésének gyorsítóivá váltak. Ezek a szekvenálási módszerek az egyes szervezetek, köztük az emberek és más élő fajok teljes genomjának szekvenálásáig fejlődtek. A mikro-sugarak és a következő generációs szekvenálás modern DNS-szekvenálási eljárások. A microarray technika kifejezetten hibridizáción alapul, amely ismert célok halmazát tartalmazza. A következő generációs szekvenálás szintézisen alapul (amely DNS-polimerázt használ a nukleotidok beépítéséhez), és képes a teljes genom szekvenálására a korábban kiválasztott céloktól függetlenül. Ez a legfontosabb különbség a Microarray és a Next Generation Sequencing között.
TARTALOM
1. Áttekintés és a legfontosabb különbség
2. Mi a Microarray
3. Mi a következő generációs szekvenálás
4. A Microarray és a Next Generation szekvenciák közötti hasonlóság
5. Egymás melletti összehasonlítás - Microarray vs Next Generation szekvencia táblázatos formában
6. Összefoglalás
Mi az a Microarray?
A DNS-mikroszkópot laboratóriumi eszközként használják, hogy egyszerre több ezer különböző génexpressziót azonosítsanak. Ez egy szilárd felület, azaz egy mikroszkóp tárgylemez, amely a rá nyomtatott mikroszkopikus DNS foltok gyűjteményét tartalmazza. Minden nyomtatott folt tartalmaz egy ismert génszekvenciát vagy gént. Ezek a tárgylemezre nyomtatott ismert próbák próbaként szolgálnak a génexpresszió kimutatására. Ezt átiratnak nevezik. A mikro-sugarak elsődleges alapja a két DNS-szál közötti hibridizáció. Ez a nukleinsavszekvenciák komplementer bázispárosítása hidrogénkötések kialakulásával.
01. ábra: Microarray
Kezdetben az mRNS-molekulákat a kísérleti mintából és egy egészséges egyéntől kapott referencia-mintából gyűjtik össze. A kísérleti mintákat beteg egyedektől nyerjük; például egy rákban szenvedő egyén. Miután megkapta, mindkét mRNS-mintát cDNS-vé (komplementer DNS-vé) alakítják. Ezután mindegyik mintát fluoreszcens szondával jelöljük. A fluoreszcens próbák különböző színűek, hogy megkülönböztessék a minta cDNS-ét a referencia cDNS-től. A cDNS-molekulák megkötésének megkezdéséhez a mikroarray tárgylemezhez a két mintát összekeverjük. A hibridizáció az a folyamat, amelynek során a cDNS-molekulák a mikroarray tárgylemezen lévő DNS-szondákhoz kapcsolódnak. Miután a hibridizáció befejeződött,reakciók sora zajlik le annak érdekében, hogy az egyes gének expresszióját az expresszált gén mennyiségének megfelelően, különböző színű megjelenéssel azonosítsák és mérjék. A mikroarray eredményeit felhasználjuk egy olyan génexpressziós profil létrehozásához, amely felhasználható a különböző betegségállapotok azonosítására.
Mi az új generációs szekvencia?
A Next Generation Sequencing (NGS) a genetikai szekvenálás fejlett módszere. Alapelve hasonló a Sanger szekvenáláshoz, amely a kapilláris elektroforézistől függ. Az NGS-ben a genomi szál fragmentálódik és egy templát szálhoz ligálódik. Az egyes szálak bázisait a ligációs folyamat során kibocsátott jelek alapján azonosítjuk. A Sanger szekvenálás módszerében három külön lépés, a szekvenálás, az elválasztás és a detektálás vesz részt. Ezen külön lépések miatt a minta előkészítésének automatizálása korlátozott teljesítményű. Az NGS-ben a technikát tömb alapú szekvenálás alkalmazásával fejlesztik ki a Sanger szekvenálási eljárás lépéseinek kombinációjával, amely több millió reakciósorozat párhuzamos végrehajtását okozhatja egyszerre; ez nagy sebességet és áteresztőképességet eredményez alacsony költség mellett.
02. ábra: Fejlesztések az NGS-ben
Az NGS három lépésből áll; könyvtár előkészítés (könyvtárak létrehozása a DNS véletlenszerű fragmentálása segítségével), amplifikálás (a könyvtár amplifikálása klonális amplifikáció és PCR alkalmazásával) és szekvenálás. Azok a genomszekvenálási folyamatok, amelyeket rendkívül hosszú ideig végeznek a Sanger-szekvenálási eljárás alkalmazásával, néhány óra alatt elvégezhetők az NGS alkalmazásával.
Mi a hasonlóság a Microarray és az új generációs szekvenciák között?
A Microarray és a Next Generation szekvenciákat tömb alapú szekvenálás segítségével fejlesztjük ki
Mi a különbség a Microarray és az új generációs szekvenciák között?
Különböző cikk a táblázat előtt
Microarray vs Next Generation Sequencing |
|
A Microarray egy szilárd felülethez rögzített mikroszkopikus DNS-foltok gyűjteménye, amelyet nagyszámú gén expressziós szintjének egyidejű mérésére használnak. | Az NGS (Next-generation sequencing) egy nem Sanger-alapú nagy áteresztőképességű DNS-szekvenálási technológia, amely megkönnyíti a DNS-szálak millióinak vagy milliárdjainak párhuzamos szekvenálását. |
Interakciók az antigénnel | |
A Microarray hibridizáción alapul, amely ismert célokból áll. | Az NGS szintézisen alapul, amely DNS-polimerázt használ a nukleotidok beépítéséhez, és független a korábban kiválasztott célpontoktól. |
Összegzés - Microarray vs Next Generation Sequencing
A kutatás összefüggésében a DNS-szekvenálás fontos gyorsítóvá vált. Széles körben használják a biotechnológiában, az orvosi diagnosztikában és az igazságügyi vizsgálatokban. Hatékonyabb és gyorsabb szekvenálási eljárásokká fejlődött és fejlődött. A mikro-sugarak és az NGS két fejlett DNS-szekvenálási technika. Mindkettőt tömb alapú szekvenálás segítségével fejlesztjük. A microarray technika a hibridizációra támaszkodik, míg az NGS szintézisre épül, amely DNS-polimerázt használ a nukleotidok beépítésére. Ez a fő különbség a Microarray és a Next Generation Sequencing között.
A Microarray vs Next Generation Sequencing PDF verziójának letöltése
A cikk PDF-verzióját letöltheti, és offline célokra is használhatja, az idézési megjegyzés szerint. Kérjük, töltse le itt a PDF verziót. Különbség a Microarray és a Next Generation Sequencing között
Ajánlott:
Difference Between Clone By Clone Sequencing And Shotgun Sequencing
The key difference between clone by clone sequencing and shotgun sequencing lies in their method of conduct. Clone by clone sequencing method involves mapp
Különbség A Telstra 3G és A Next G és A 4G LTE Között
Telstra 3G vs Next G vs 4G LTE | Következő G telefonok vs 4G LTE telefonok A Next G modem és a 4G LTE modemek A Telstra 3G, a Next G és a 4G mobil kommunikációs hálózatok
Különbség A Telstra Next G Xoom és Az Apple IPad 2 Között
Telstra Next G Xoom vs Apple iPad 2 | Teljes specifikációk összehasonlítva | Ausztrália Motorola Xoom vs iPad 2 sebesség, jellemzők és teljesítmény | Telstra árak és tervek
Különbség A Sony Quad Core Next Gen PSP (PSP2) és A Nintendo 3DS Között
Sony Quad Core Next Gen PSP (PSP2) és Nintendo 3DS A Sony Quad Core Next Gen PSP (PSP2) és a Nintendo 3DS a Sony következő generációs játékkonzoljai és
Különbség A Microarray és Az RNS Szekvenálás Között
Kulcskülönbség - Microarray vs RNS Sequencing Transcriptome reprezentálja a sejtben jelenlévő RNS teljes tartalmát, beleértve az mRNS-t, az rRNS-t, a tRNS-t, a lebomlott RN