Fő különbség - Microarray vs Next Generation Squencing
A DNS-szekvenálási folyamatokat széles körben alkalmazzák a biotechnológia, a virológia, az orvosi diagnózis és az igazságügyi tudományok területén. Ez egy olyan folyamat, amely meghatározza a DNS-molekulában jelenlévő nukleotidok, adenin, guanin, timin és citozin pontos sorrendjét. A DNS-szekvenálási eljárások az orvosi és biológiai kutatások csodálatos felfedezésének gyorsítóivá váltak. Ezek a szekvenálási módszerek az egyes szervezetek, köztük az emberek és más élő fajok teljes genomjának szekvenálásáig fejlődtek. A mikro-sugarak és a következő generációs szekvenálás modern DNS-szekvenálási eljárások. A microarray technika kifejezetten hibridizáción alapul, amely ismert célok halmazát tartalmazza. A következő generációs szekvenálás szintézisen alapul (amely DNS-polimerázt használ a nukleotidok beépítéséhez), és képes a teljes genom szekvenálására a korábban kiválasztott céloktól függetlenül. Ez a legfontosabb különbség a Microarray és a Next Generation Sequencing között.
TARTALOM
1. Áttekintés és a legfontosabb különbség
2. Mi a Microarray
3. Mi a következő generációs szekvenálás
4. A Microarray és a Next Generation szekvenciák közötti hasonlóság
5. Egymás melletti összehasonlítás - Microarray vs Next Generation szekvencia táblázatos formában
6. Összefoglalás
Mi az a Microarray?
A DNS-mikroszkópot laboratóriumi eszközként használják, hogy egyszerre több ezer különböző génexpressziót azonosítsanak. Ez egy szilárd felület, azaz egy mikroszkóp tárgylemez, amely a rá nyomtatott mikroszkopikus DNS foltok gyűjteményét tartalmazza. Minden nyomtatott folt tartalmaz egy ismert génszekvenciát vagy gént. Ezek a tárgylemezre nyomtatott ismert próbák próbaként szolgálnak a génexpresszió kimutatására. Ezt átiratnak nevezik. A mikro-sugarak elsődleges alapja a két DNS-szál közötti hibridizáció. Ez a nukleinsavszekvenciák komplementer bázispárosítása hidrogénkötések kialakulásával.
01. ábra: Microarray
Kezdetben az mRNS-molekulákat a kísérleti mintából és egy egészséges egyéntől kapott referencia-mintából gyűjtik össze. A kísérleti mintákat beteg egyedektől nyerjük; például egy rákban szenvedő egyén. Miután megkapta, mindkét mRNS-mintát cDNS-vé (komplementer DNS-vé) alakítják. Ezután mindegyik mintát fluoreszcens szondával jelöljük. A fluoreszcens próbák különböző színűek, hogy megkülönböztessék a minta cDNS-ét a referencia cDNS-től. A cDNS-molekulák megkötésének megkezdéséhez a mikroarray tárgylemezhez a két mintát összekeverjük. A hibridizáció az a folyamat, amelynek során a cDNS-molekulák a mikroarray tárgylemezen lévő DNS-szondákhoz kapcsolódnak. Miután a hibridizáció befejeződött,reakciók sora zajlik le annak érdekében, hogy az egyes gének expresszióját az expresszált gén mennyiségének megfelelően, különböző színű megjelenéssel azonosítsák és mérjék. A mikroarray eredményeit felhasználjuk egy olyan génexpressziós profil létrehozásához, amely felhasználható a különböző betegségállapotok azonosítására.
Mi az új generációs szekvencia?
A Next Generation Sequencing (NGS) a genetikai szekvenálás fejlett módszere. Alapelve hasonló a Sanger szekvenáláshoz, amely a kapilláris elektroforézistől függ. Az NGS-ben a genomi szál fragmentálódik és egy templát szálhoz ligálódik. Az egyes szálak bázisait a ligációs folyamat során kibocsátott jelek alapján azonosítjuk. A Sanger szekvenálás módszerében három külön lépés, a szekvenálás, az elválasztás és a detektálás vesz részt. Ezen külön lépések miatt a minta előkészítésének automatizálása korlátozott teljesítményű. Az NGS-ben a technikát tömb alapú szekvenálás alkalmazásával fejlesztik ki a Sanger szekvenálási eljárás lépéseinek kombinációjával, amely több millió reakciósorozat párhuzamos végrehajtását okozhatja egyszerre; ez nagy sebességet és áteresztőképességet eredményez alacsony költség mellett.
02. ábra: Fejlesztések az NGS-ben
Az NGS három lépésből áll; könyvtár előkészítés (könyvtárak létrehozása a DNS véletlenszerű fragmentálása segítségével), amplifikálás (a könyvtár amplifikálása klonális amplifikáció és PCR alkalmazásával) és szekvenálás. Azok a genomszekvenálási folyamatok, amelyeket rendkívül hosszú ideig végeznek a Sanger-szekvenálási eljárás alkalmazásával, néhány óra alatt elvégezhetők az NGS alkalmazásával.
Mi a hasonlóság a Microarray és az új generációs szekvenciák között?
A Microarray és a Next Generation szekvenciákat tömb alapú szekvenálás segítségével fejlesztjük ki
Mi a különbség a Microarray és az új generációs szekvenciák között?
Különböző cikk a táblázat előtt
Microarray vs Next Generation Sequencing |
|
| A Microarray egy szilárd felülethez rögzített mikroszkopikus DNS-foltok gyűjteménye, amelyet nagyszámú gén expressziós szintjének egyidejű mérésére használnak. | Az NGS (Next-generation sequencing) egy nem Sanger-alapú nagy áteresztőképességű DNS-szekvenálási technológia, amely megkönnyíti a DNS-szálak millióinak vagy milliárdjainak párhuzamos szekvenálását. |
| Interakciók az antigénnel | |
| A Microarray hibridizáción alapul, amely ismert célokból áll. | Az NGS szintézisen alapul, amely DNS-polimerázt használ a nukleotidok beépítéséhez, és független a korábban kiválasztott célpontoktól. |
Összegzés - Microarray vs Next Generation Sequencing
A kutatás összefüggésében a DNS-szekvenálás fontos gyorsítóvá vált. Széles körben használják a biotechnológiában, az orvosi diagnosztikában és az igazságügyi vizsgálatokban. Hatékonyabb és gyorsabb szekvenálási eljárásokká fejlődött és fejlődött. A mikro-sugarak és az NGS két fejlett DNS-szekvenálási technika. Mindkettőt tömb alapú szekvenálás segítségével fejlesztjük. A microarray technika a hibridizációra támaszkodik, míg az NGS szintézisre épül, amely DNS-polimerázt használ a nukleotidok beépítésére. Ez a fő különbség a Microarray és a Next Generation Sequencing között.
A Microarray vs Next Generation Sequencing PDF verziójának letöltése
A cikk PDF-verzióját letöltheti, és offline célokra is használhatja, az idézési megjegyzés szerint. Kérjük, töltse le itt a PDF verziót. Különbség a Microarray és a Next Generation Sequencing között
