A konzervált és konszenzus szekvencia közötti legfontosabb különbség az, hogy a konzervált szekvencia hasonló nukleinsavak vagy aminosavak szekvenciáira utal, amelyek különböző vagy azonos fajokban fordulnak elő generációk során, míg a konszenzus szekvencia egy gyakran előforduló nukleotid szekvencia vagy aminosav szekvencia, amely egy erősen konzervált régióban található. DNS vagy RNS vagy fehérje.
Az organizmusoknak hasonló és eltérő tulajdonságaik vannak. Az élőlények közötti kapcsolatok tanulmányozása és osztályozása során nagyon fontos a szervezetek genomja vagy genetikai felépítése. Vannak olyan nukleotid- vagy aminosav-szekvenciák, amelyek gyakoriak a különböző organizmusok között. A konzervált szekvencia olyan nukleinsav- vagy aminosav-szekvencia, amely konzisztens a fajok között. Ezért filogenetikailag fontosak a filogenetikai fák létrehozásakor. Konzervált szekvenciákban vannak specifikus nukleotidszekvenciák, amelyek gyakrabban találhatók meg. Konszenzus szekvenciákként ismertek.
