A legfontosabb különbség az allozimok és az izozimok között az, hogy az allozimokat különböző allélok kódolják ugyanazon a lokuszon. De ezzel ellentétben az izozimákat különböző lokuszokban lévő gének kódolják.
Az enzimek olyan biokatalizátorok, amelyek felgyorsítják a biokémiai reakciókat. Valójában ezek gének által kódolt fehérjemolekulák. Különböző típusú enzimek léteznek. Néhány enzimet ugyanazon gén különböző alléljai kódolnak ugyanazon a lokuszon. Allozimekként ismertek. Ezzel szemben egyes enzimeket különböző gének kódolnak, amelyek különböző lokuszokban helyezkednek el. Ezeket az enzimeket izozimként ismerjük. Az izozimok és az allozimek felhasználhatók két szervezet kapcsolatának meghatározására.