A közvetlen különbség a közvetlen és a közvetett immunfluoreszcencia között az, hogy a közvetlen immunfluoreszcencia egyetlen antitestet használ, amely a kívánt cél ellen hat, míg a közvetett immunfluoreszcencia két antitestet használ a kívánt cél megjelölésére.
Az immunfluoreszcencia vagy a sejtképalkotás olyan technika, amelyet egy adott célantigén fluoroforral történő jelölésére használnak. Itt a fluorofor egy fluoreszcens kémiai vegyület, amely fény gerjesztésével újra fényt bocsáthat ki. Amikor egy fluorofor kötődik a célantigénhez, lehetővé teszi a célmolekula kimutatását a mintában. További leírása, amikor egy antigén kötődik egy specifikus antitesthez, akkor konjugálható fluoroforokkal. Ennélfogva könnyű kimutatni a célantigén jelenlétét a mintában, amikor a fluoreszcens mikroszkóp alatt megfigyeljük.
Ezenkívül kétféle immunfluoreszcencia létezik; közvetlen és közvetett immunfluoreszcencia. A közvetlen és a közvetett immunfluoreszcencia közötti különbség elsősorban az alkalmazott antitestek számában és a fluorofór konjugációban rejlik. Vagyis közvetlen immunfluoreszcencia esetén a fluorofor közvetlenül konjugálódik az elsődleges antitesthez, míg közvetett immunfluoreszcencia esetén a fluorofor konjugálódik a szekunder antitesthez.
