Fő különbség - Alapkivágás javítás vs Nukleotid kivágás javítás
A DNS-t gyakran károsítják különböző belső és külső tényezők. A sejtjavító rendszerek azonban azonnal és folyamatosan korrigálják a károsodásokat, még mielőtt azok mutációvá válnának, vagy mielőtt átkerülnének a következő generációkra. A sejtekben háromféle excízió-helyreállító rendszer létezik: a nukleotid-excision-javítás (NER), az alap-excízió-javítás (BER) és a DNS-eltérés helyreállítása (MMR) az egyszálú DNS-károsodások helyrehozására. A legfontosabb különbség az alapkivágási javítás és a nukleotid-kimetszés-javítás között az, hogy az alapkivágási javítás egy egyszerű javítórendszer, amely a sejtekben az endogén módon okozott egyetlen nukleotidkárosodás kijavítására szolgál, míg a nukleotidkivágás-javítás olyan összetett javítórendszer, amely a sejtekben összehasonlító módon javít nagyobb, sérült régiók exogén módon okoztak.
TARTALOM
1. Áttekintés és kulcsfontosságú különbség
2. Mi az alapkivágás javítása
3. Mi a nukleotid kivágás javítása
4. Egymás melletti összehasonlítás - Alap kivágás javítás vs Nukleotid kivágás javítás
5. Összegzés
Mi az alapkivágási javítás?
Az alapkivágási javítás a sejtek DNS-javító rendszerének legegyszerűbb változata. A DNS kisebb károsodásainak orvoslására szolgál. A DNS-bázisok dezaminálás vagy alkilezés miatt módosulnak. Báziskárosodás esetén a DNS-glikoziláz felismeri és aktiválja a bázis kivágás-helyreállító rendszerét, és az AP endonukleáz, DNS-polimeráz és DNS-ligáz enzimek segítségével helyreállítja. A BER rendszer a következő lépésekkel jár.
- Helytelen vagy sérült bázis felismerése és eltávolítása DNS-glikoziláz segítségével abasikus hely létrehozásához (a bázisvesztés helyei –apiurinin vagy apirimidin helyek).
- Apurinic / apyrimidin endonukleáz abasikus metszése
- A megmaradt cukortöredék eltávolítása lyázzal vagy foszfodiészterázzal
- Hézagkitöltés DNS-polimeráz segítségével
- A nick lezárása DNS-ligáz segítségével
01. ábra: Alap kivágási javítási útvonal
Mi az a nukleotid kivágás javítása?
A nukleotid-excíziós javítás (NER) a sejtek fontos DNS-excízió-helyreállító rendszere. Képes megjavítani és pótolni a sérült területeket, legfeljebb 30 bázis hosszúságú, és a sértetlen sablonszál irányítja. Gyakori DNS károsodás következik be az ultraibolya sugárzás miatt, és a NER megvédi a DNS-t azáltal, hogy kijavítja ezeket a károsodásokat közvetlenül a mutációkká válás előtt és a következő generációkba való átjutás előtt, vagy betegségeket okoz. A NER kifejezetten védelmet nyújt az exogén tényezők, például a környezeti és kémiai rákkeltő anyagok által közvetetten okozott mutációk ellen. A NER szinte minden organizmusban látható, és felismeri azokat a károsodásokat, amelyek jelentős torzulásokat okoznak a DNS-spirálban.
A NER folyamat számos fehérje, például XPA, XPB, XPC, XPD, XPE, XPF, XPG, CSA, CSB stb. Hatását vonja maga után, és számos vágott és pasztaszerű mechanizmuson keresztül halad. Ezek a fehérjék elengedhetetlenek a javítási folyamat befejezéséhez, és az egyik NER fehérje hiánya létfontosságú és ritka recesszív szindrómákat okozhat: xeroderma pigmentosum (XP), Cockayne-szindróma (CS) és a törékeny hajzavar fényérzékeny formája. trichothiodystrophia (TTD).
02. ábra: Nukleotid excíziós javítás
Mi a különbség az alapkivágás javítása és a nukleotid kivágás javítása között?
Különböző cikk a táblázat előtt
Alapkivágás javítás vs nukleotid kivágás javítás |
|
| Az alapkivágási javítás (BER) a sejtekben előforduló DNS-javító rendszer. | A nukleotidok excíziós helyreállítása (NER) a sejtekben található DNS-javító rendszerek másik típusa. |
| A DNS-adduktok felismerése | |
| A BER helyreállítja a kis DNS-adduktumok károsodását. | A NER helyreállítja a nagy DNS-adduktokat. |
| DNS károsodások | |
| A BER elismeri azokat a károkat, amelyek nem okoznak jelentős torzulásokat a DNS-spirálban. | A NER felismeri azokat a károkat, amelyek jelentős torzulásokat okoznak a DNS-spirálban. |
| A DNS károsodásának okai | |
| A BER helyreállítja az endogén mutagének által okozott károkat. | A NER kijavítja az exogén mutagének által okozott károkat. |
| Bonyolultság | |
| A BER a legkomplexebb javítási rendszer | Összetettebb, mint a BER. |
| Szüksége a fehérjékre | |
| A BER nem igényel más fehérjéket. | A NER-nek több géntermékre, különösen fehérjékre van szüksége a sérült és sértetlen régiók megkülönböztetéséhez. |
| Alkalmasság | |
| A BER alkalmas az egyalapú károk korrigálására. | A NER alkalmas a sérült régiók pótlására. |
Összegzés - Alapkivágás javítás vs Nukleotid kivágás javítás
A NER és a BER kétféle DNS-kimetszés-helyreállítási folyamat, amely a sejtekben található meg. A BER képes kijavítani az endogén módon okozott kisméretű károkat, míg a NER a 30 bázispár hosszúságig terjedő, elsősorban exogén eredetű károkat. A BER a felismert szubsztrátok típusaiban és a kezdeti hasítási eseményben különbözik a NER-től. A BER felismeri azokat a károkat is, amelyeket nem a DNS-spirál jelentős torzulásai okoztak, míg a NER a DNS-spirál jelentős torzulásait. Ez a különbség a bázis és a nukleotidok kivágása között.
Kép jóvoltából:
1. “Dna repair base excersion en” Írta LadyofHats - (Public Domain) a Commons Wikimedia-n keresztül.
2. “Az Uvr fehérjék által vezérelt nukleotidkivágási helyreállítási útvonal modelljeinek sematikus ábrázolása” Rihito Morita, Shuhei Nakane, Atsuhiro Shimada, Masao Inoue, Hitoshi Iino, Taisuke Wakamatsu, Kenji Fukui, Noriko Nakagawa, Ryoji Masui és Seiki Kuramitsu - (CC BY 1.0) a Commons Wikimedia segítségével
